要申请中巴FTA原产地证（即《中国-巴基斯坦自由贸易区优惠原产地证明书》），您可以考虑以下两个主要机构进行申请：

中国国际贸易促进委员会（贸促会）：

贸促会是签发中巴FTA原产地证的重要机构之一。

您可以通过贸促会或前往其办公地点了解具体的申请流程和所需材料。

海关机构：

中国的海关机构也负责签发中巴FTA原产地证。

您可以登录中国海关，如“互联网+海关”一体化网上办事平台（http://online.customs.gov.cn/），在税费业务-原产地证管理-原产地证书签发中选择对应的“中国-巴基斯坦FTA原产地证”后进行证书申报。

或者通过中国国际贸易“单一窗口”（https://www.singlewindow.cn/），点击“海关原产地证书”选择相应的中国-巴基斯坦FTA原产地证填制后进行证书申请。

在申请中巴FTA原产地证时，您需要准备以下材料：

填写完整的原产地证书申请表，包括出口商品信息、生产商信息等。

商业发票，显示出口商品详细信息的商业发票正本。

装箱单，详细列明出口商品的包装、数量、重量等信息的装箱单。

运输单据，如提单、运单等，显示出口商品的运输信息。

进口商信息，包括进口商的公司名称、地址、联系方式等。

其他相关文件，如生产厂的注册证明、质量检测报告等（根据具体要求而定）。

请注意，不同地区的海关或贸促会可能有具体的申请要求和流程，建议您在申请前详细咨询当地的相关机构以获取准确的信息。

此外，如果您是贸易公司且无法进行产品预审备案，您可以选择在其他审核要求相对宽松的海关进行申请，或者寻求专业的外贸单证服务商的协助。同时，中巴FTA产地证是支持原产地证自助打印服务的，但前提是先在系统开通原产地证自助打印服务。