申请中国-东盟自由贸易协定原产地证书（FORM E）需要准备以下材料：

企业基本信息文件：

企业法人营业执照、公司章程和组织机构代码证等，用于证明公司的合法性和经营资格。

公司的注册证明及授权证明，包括出口商的详细信息和联系方式。

出口产品信息文件：

产品的详细描述，包括产品的名称、型号、数量、价格、原材料采购来源、加工过程、生产设备等，以证明产品的原产地以及符合东盟原产地规定。

商品的完整清单和分类，描述产品的特点、用途和规格等。

商业发票或形式发票，需加盖企业公章，并包含产品详细信息，如产品名称、数量、单价等。

装箱单或装运单，需详细列明产品包装和运输情况。

运输与合同文件：

运输单据，如提单、空运单等，证明货物已经或即将运输。

出口合同或订单，需为有效合同或订单，且与实际出口情况相符。

其他文件：

根据进口国要求，可能需要提供的额外文件，如产地声明、质量证明等。

原产地证申请人登记表和授权书。

在准备好上述材料后，需要按照以下步骤进行申请：

登录中国国际贸易促进委员会（贸促会）或中国出入境检验检疫局（检验检疫局），下载并填写《东盟FORM E原产地证申请表》。

将申请表和准备好的材料一并提交至当地贸促会或检验检疫局进行审核。

如果提交的资料齐全且符合要求，贸促会或检验检疫局将进行审核，并出具东盟FORM E原产地证证书。

申请人需按照规定时间到当地贸促会或检验检疫局领取证书。

请注意，申请中国-东盟自由贸易协定原产地证书时，应确保所有信息的真实性和准确性，并遵守相关的法律法规和规定。同时，不同地区的具体申请流程和材料要求可能有所不同，建议咨询当地贸促会或检验检疫局的工作人员以获取详细信息。